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读取nii或nii.gz文件中的信息即输出图像操作
脚本专栏 2024/11/2 佚名
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读取nii或者nii.gz文件中的信息，并且输出图像。

import matplotlib
from matplotlib import pylab as plt
import nibabel as nib
from nibabel.viewers import OrthoSlicer3D
file = '' #你的nii或者nii.gz文件路径
img = nib.load(file) 
 
print(img)
print(img.header['db_name']) #输出nii的头文件
width, height, queue = img.dataobj.shape
OrthoSlicer3D(img.dataobj).show()
 
num = 1
for i in range(0, queue, 10):
 img_arr = img.dataobj[:,:,i]
 plt.subplot(5,4,num)
 plt.imshow(img_arr, cmap='gray')
 num += 1
 
plt.show()

补充知识：SimpleITK读取医学图像 .nii 数据（2D显示）

【环境】win10 + python3.6 + SimpleITK

nii文件是NIFTI格式的文件，出现的原因是原来一种图像格式是ANALYZE 7.5 format，但是这个图像格式缺少一些信息，比如没有方向信息，病人的左右方位等，如果需要包括额外的信息，就需要一个额外的文件，比如ANALYZE7.5就需要一对<.hdr, .img>文件来保存图像的完整信息。

因此，解决这个问题Data Format Working Group (DFWG) 将图像格式完整的定义为NIFTI（Neuroimaging Informatics Technology Initiative）格式

import SimpleITK as sitk
import skimage.io as io

def read_img(path):
 img = sitk.ReadImage(path)
 data = sitk.GetArrayFromImage(img)
 return data
#显示一个系列图
def show_img(data):
 for i in range(data.shape[0]):
  io.imshow(data[i,:,:], cmap = 'gray')
  print(i)
  io.show()
 
#单张显示
def show_img(ori_img):
 io.imshow(ori_img[100], cmap = 'gray')
 io.show()

#window下的文件夹路径 
path = 'D:\\datasets\\Naso_GTV\\1\\data.nii.gz'
data = read_img(path)
show_img(data)

读取nii或nii.gz文件中的信息即输出图像操作

img = sitk.ReadImage(path)
#查看图片深度
print(img.GetDepth())
#144 共144张图
#查看Size
print(img.GetSize())
#(512,512,144) 像素：512*512， 144张图片

更多的函数自己去发现

读取nii或nii.gz文件中的信息即输出图像操作

以上这篇读取nii或nii.gz文件中的信息即输出图像操作就是小编分享给大家的全部内容了，希望能给大家一个参考，也希望大家多多支持。

标签：
nii,nii.gz文件,输出图像
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3月27日消息，苹果宣布2024年全球开发者大会（WWDC）将于6月10日至6月14日举行，巧合的是，这次大会与端午假期重合。

苹果官方表示：

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RTX 5090要首发 性能要翻倍！三星展示GDDR7显存

三星在GTC上展示了专为下一代游戏GPU设计的GDDR7内存。

首次推出的GDDR7内存模块密度为16GB，每个模块容量为2GB。其速度预设为32 Gbps（PAM3），但也可以降至28 Gbps，以提高产量和初始阶段的整体性能和成本效益。

据三星表示，GDDR7内存的能效将提高20%，同时工作电压仅为1.1V，低于标准的1.2V。通过采用更新的封装材料和优化的电路设计，使得在高速运行时的发热量降低，GDDR7的热阻比GDDR6降低了70%。

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